Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBX1P62877 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBX1P62877 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBX1P62877 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBX1P62877 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBX1P62877 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBX1P62877 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBX1P62877 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBX1P62877 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBX1P62877 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBX1P62877 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBX1P62877 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBX1P62877 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBX1P62877 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBX1P62877 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBX1P62877 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBX1P62877 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBX1P62877 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBX1P62877 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBX1P62877 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBX1P62877 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBX1P62877 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBX1P62877 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBX1P62877 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBX1P62877 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBX1P62877 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBX1P62877 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RBX1P62877 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBX1P62877 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBX1P62877 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBX1P62877 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBX1P62877 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBX1P62877 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBX1P62877 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBX1P62877 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBX1P62877 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBX1P62877 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RBX1P62877 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBX1P62877 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBX1P62877 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBX1P62877 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBX1P62877 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBX1P62877 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBX1P62877 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBX1P62877 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBX1P62877 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBX1P62877 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBX1P62877 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBX1P62877 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBX1P62877 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBX1P62877 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBX1P62877 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBX1P62877 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBX1P62877 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBX1P62877 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBX1P62877 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBX1P62877 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBX1P62877 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBX1P62877 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBX1P62877 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBX1P62877 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBX1P62877 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBX1P62877 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBX1P62877 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBX1P62877 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBX1P62877 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBX1P62877 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBX1P62877 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBX1P62877 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBX1P62877 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBX1P62877 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RBX1P62877 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBX1P62877 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBX1P62877 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBX1P62877 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBX1P62877 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBX1P62877 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBX1P62877 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBX1P62877 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBX1P62877 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBX1P62877 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBX1P62877 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBX1P62877 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RBX1P62877 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBX1P62877 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms