Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOBP62745 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOBP62745 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RHOBP62745 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RHOBP62745 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RHOBP62745 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHOBP62745 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHOBP62745 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RHOBP62745 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RHOBP62745 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOBP62745 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOBP62745 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOBP62745 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOBP62745 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOBP62745 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RHOBP62745 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOBP62745 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOBP62745 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOBP62745 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOBP62745 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RHOBP62745 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOBP62745 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOBP62745 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RHOBP62745 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOBP62745 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOBP62745 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOBP62745 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RHOBP62745 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOBP62745 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOBP62745 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHOBP62745 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHOBP62745 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOBP62745 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOBP62745 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOBP62745 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOBP62745 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOBP62745 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHOBP62745 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOBP62745 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHOBP62745 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOBP62745 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOBP62745 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOBP62745 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHOBP62745 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RHOBP62745 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RHOBP62745 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOBP62745 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOBP62745 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHOBP62745 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOBP62745 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOBP62745 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOBP62745 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHOBP62745 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHOBP62745 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOBP62745 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOBP62745 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOBP62745 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHOBP62745 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RHOBP62745 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RHOBP62745 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RHOBP62745 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RHOBP62745 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RHOBP62745 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RHOBP62745 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RHOBP62745 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RHOBP62745 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RHOBP62745 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RHOBP62745 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RHOBP62745 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RHOBP62745 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHOBP62745 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHOBP62745 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RHOBP62745 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHOBP62745 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHOBP62745 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RHOBP62745 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHOBP62745 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHOBP62745 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHOBP62745 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHOBP62745 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHOBP62745 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHOBP62745 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHOBP62745 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHOBP62745 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHOBP62745 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHOBP62745 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOBP62745 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOBP62745 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOBP62745 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOBP62745 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOBP62745 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHOBP62745 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOBP62745 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RHOBP62745 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms