Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RND3P61587 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RND3P61587 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RND3P61587 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RND3P61587 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RND3P61587 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RND3P61587 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RND3P61587 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RND3P61587 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RND3P61587 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RND3P61587 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RND3P61587 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RND3P61587 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RND3P61587 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RND3P61587 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RND3P61587 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RND3P61587 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RND3P61587 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RND3P61587 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RND3P61587 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RND3P61587 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RND3P61587 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RND3P61587 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RND3P61587 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RND3P61587 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RND3P61587 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RND3P61587 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RND3P61587 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RND3P61587 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RND3P61587 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RND3P61587 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RND3P61587 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RND3P61587 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RND3P61587 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RND3P61587 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RND3P61587 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RND3P61587 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RND3P61587 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RND3P61587 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RND3P61587 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RND3P61587 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RND3P61587 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RND3P61587 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RND3P61587 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RND3P61587 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RND3P61587 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RND3P61587 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RND3P61587 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RND3P61587 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RND3P61587 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RND3P61587 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RND3P61587 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RND3P61587 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RND3P61587 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RND3P61587 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RND3P61587 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RND3P61587 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RND3P61587 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RND3P61587 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RND3P61587 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RND3P61587 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RND3P61587 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RND3P61587 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RND3P61587 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RND3P61587 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RND3P61587 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RND3P61587 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RND3P61587 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RND3P61587 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RND3P61587 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RND3P61587 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RND3P61587 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RND3P61587 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RND3P61587 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RND3P61587 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RND3P61587 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RND3P61587 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RND3P61587 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RND3P61587 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RND3P61587 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RND3P61587 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RND3P61587 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RND3P61587 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RND3P61587 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RND3P61587 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RND3P61587 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RND3P61587 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RND3P61587 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RND3P61587 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RND3P61587 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RND3P61587 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RND3P61587 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RND3P61587 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RND3P61587 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RND3P61587 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RND3P61587 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RND3P61587 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RND3P61587 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RND3P61587 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RND3P61587 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms