Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42P60953 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42P60953 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42P60953 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42P60953 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42P60953 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42P60953 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42P60953 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42P60953 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42P60953 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42P60953 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42P60953 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42P60953 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42P60953 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42P60953 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42P60953 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42P60953 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42P60953 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42P60953 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42P60953 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42P60953 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42P60953 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42P60953 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42P60953 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42P60953 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42P60953 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42P60953 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42P60953 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42P60953 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42P60953 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42P60953 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42P60953 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42P60953 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42P60953 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42P60953 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42P60953 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42P60953 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42P60953 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42P60953 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42P60953 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42P60953 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42P60953 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42P60953 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42P60953 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42P60953 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42P60953 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42P60953 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42P60953 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42P60953 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42P60953 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42P60953 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42P60953 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42P60953 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42P60953 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42P60953 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42P60953 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42P60953 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42P60953 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42P60953 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42P60953 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42P60953 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC42P60953 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42P60953 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42P60953 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42P60953 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42P60953 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42P60953 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42P60953 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42P60953 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42P60953 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42P60953 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42P60953 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42P60953 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC42P60953 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42P60953 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC42P60953 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42P60953 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC42P60953 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42P60953 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC42P60953 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC42P60953 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42P60953 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42P60953 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC42P60953 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42P60953 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42P60953 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42P60953 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC42P60953 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms