Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRTAP10-9P60411 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRTAP10-9P60411 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP10-9P60411 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP10-9P60411 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP10-9P60411 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms