Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STX17P56962 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX17P56962 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX17P56962 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX17P56962 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STX17P56962 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STX17P56962 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STX17P56962 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STX17P56962 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STX17P56962 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STX17P56962 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX17P56962 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX17P56962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
STX17P56962 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX17P56962 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX17P56962 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX17P56962 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
STX17P56962 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
STX17P56962 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX17P56962 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
STX17P56962 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STX17P56962 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STX17P56962 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STX17P56962 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STX17P56962 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STX17P56962 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STX17P56962 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STX17P56962 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STX17P56962 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STX17P56962 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STX17P56962 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STX17P56962 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX17P56962 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STX17P56962 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STX17P56962 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STX17P56962 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STX17P56962 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX17P56962 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX17P56962 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX17P56962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX17P56962 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX17P56962 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STX17P56962 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX17P56962 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX17P56962 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX17P56962 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX17P56962 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX17P56962 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX17P56962 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX17P56962 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX17P56962 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX17P56962 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX17P56962 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX17P56962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX17P56962 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX17P56962 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX17P56962 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
STX17P56962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STX17P56962 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STX17P56962 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX17P56962 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX17P56962 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX17P56962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX17P56962 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX17P56962 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX17P56962 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX17P56962 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX17P56962 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STX17P56962 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX17P56962 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX17P56962 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX17P56962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX17P56962 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STX17P56962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STX17P56962 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STX17P56962 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STX17P56962 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STX17P56962 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX17P56962 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX17P56962 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX17P56962 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX17P56962 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX17P56962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX17P56962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX17P56962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX17P56962 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX17P56962 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX17P56962 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX17P56962 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX17P56962 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STX17P56962 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STX17P56962 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX17P56962 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX17P56962 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX17P56962 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX17P56962 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX17P56962 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX17P56962 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX17P56962 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STX17P56962 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms