Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFERP55789 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFERP55789 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFERP55789 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFERP55789 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFERP55789 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFERP55789 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFERP55789 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFERP55789 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFERP55789 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFERP55789 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFERP55789 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFERP55789 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFERP55789 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFERP55789 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFERP55789 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFERP55789 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFERP55789 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFERP55789 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFERP55789 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GFERP55789 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFERP55789 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFERP55789 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GFERP55789 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFERP55789 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFERP55789 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GFERP55789 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GFERP55789 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GFERP55789 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GFERP55789 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GFERP55789 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GFERP55789 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GFERP55789 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GFERP55789 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFERP55789 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFERP55789 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFERP55789 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFERP55789 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GFERP55789 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFERP55789 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFERP55789 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFERP55789 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFERP55789 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFERP55789 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFERP55789 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GFERP55789 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFERP55789 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFERP55789 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFERP55789 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFERP55789 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFERP55789 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFERP55789 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFERP55789 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFERP55789 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFERP55789 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFERP55789 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GFERP55789 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFERP55789 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFERP55789 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFERP55789 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GFERP55789 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFERP55789 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFERP55789 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GFERP55789 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GFERP55789 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFERP55789 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFERP55789 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GFERP55789 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFERP55789 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFERP55789 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFERP55789 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFERP55789 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFERP55789 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GFERP55789 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GFERP55789 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GFERP55789 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GFERP55789 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GFERP55789 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFERP55789 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFERP55789 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GFERP55789 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFERP55789 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFERP55789 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GFERP55789 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms