Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP9P55211 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP9P55211 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP9P55211 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP9P55211 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP9P55211 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP9P55211 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP9P55211 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP9P55211 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP9P55211 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP9P55211 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP9P55211 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP9P55211 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP9P55211 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP9P55211 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP9P55211 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP9P55211 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP9P55211 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP9P55211 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP9P55211 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP9P55211 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASP9P55211 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP9P55211 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP9P55211 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CASP9P55211 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP9P55211 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP9P55211 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP9P55211 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP9P55211 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASP9P55211 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CASP9P55211 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP9P55211 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP9P55211 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP9P55211 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP9P55211 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP9P55211 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP9P55211 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP9P55211 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP9P55211 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP9P55211 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP9P55211 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP9P55211 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP9P55211 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP9P55211 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP9P55211 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP9P55211 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP9P55211 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP9P55211 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP9P55211 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP9P55211 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP9P55211 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP9P55211 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP9P55211 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP9P55211 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP9P55211 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP9P55211 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP9P55211 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP9P55211 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP9P55211 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP9P55211 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP9P55211 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP9P55211 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP9P55211 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP9P55211 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP9P55211 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP9P55211 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP9P55211 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP9P55211 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP9P55211 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP9P55211 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP9P55211 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP9P55211 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP9P55211 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP9P55211 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP9P55211 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP9P55211 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP9P55211 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP9P55211 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP9P55211 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP9P55211 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP9P55211 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP9P55211 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP9P55211 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP9P55211 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP9P55211 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP9P55211 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP9P55211 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP9P55211 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP9P55211 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP9P55211 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP9P55211 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP9P55211 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP9P55211 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP9P55211 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP9P55211 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP9P55211 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP9P55211 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP9P55211 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP9P55211 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP9P55211 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms