Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRISP1P54107 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRISP1P54107 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRISP1P54107 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRISP1P54107 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRISP1P54107 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRISP1P54107 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms