Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	SSN3	YPL042C	1668 nt		9.54	□□□□□ -0.88
KTR6	P54070	YJL055W	YJL055W	738 nt		9.53	□□□□□ -0.88
KTR6	P54070	YLR349W	YLR349W	507 nt		9.53	□□□□□ -0.88
KTR6	P54070	OYE3	YPL171C	1203 nt		9.51	□□□□□ -0.89
KTR6	P54070	BNI5	YNL166C	1347 nt		9.5	□□□□□ -0.89
KTR6	P54070	YEL008W	YEL008W	381 nt		9.49	□□□□□ -0.89
KTR6	P54070	YJL067W	YJL067W	351 nt		9.49	□□□□□ -0.89
KTR6	P54070	PHO23	YNL097C	993 nt		9.49	□□□□□ -0.89
KTR6	P54070	SEC61	YLR378C	1443 nt		9.47	□□□□□ -0.89
KTR6	P54070	SAM2	YDR502C	1155 nt		9.46	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	PET8	YNL003C	855 nt		9.46	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	LSB5	YCL034W	1065 nt		9.46	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	MSC1	YML128C	1542 nt		9.46	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	OXA1	YER154W	1209 nt		9.45	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	SAM3	YPL274W	1764 nt		9.45	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	YJL118W	YJL118W	660 nt		9.44	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	NUC1	YJL208C	990 nt		9.44	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	RPT5	YOR117W	1305 nt		9.41	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	ADH7	YCR105W	1086 nt		9.41	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	FLR1	YBR008C	1647 nt		9.41	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	YAT1	YAR035W	2064 nt		9.41	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	RDN25-1	RDN25-1	3396 nt		9.4	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	RDN25-2	RDN25-2	3396 nt		9.4	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	GPN2	YOR262W	1044 nt		9.4	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	GAL3	YDR009W	1563 nt		9.4	□□□□□ -0.9
KTR6	P54070	DLD2	YDL178W	1593 nt		9.39	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	FUB1	YCR076C	753 nt		9.39	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	YER188W	YER188W	720 nt		9.39	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	BSP1	YPR171W	1731 nt		9.37	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	PAU15	YIR041W	375 nt		9.37	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	FMS1	YMR020W	1527 nt		9.36	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	CPD1	YGR247W	720 nt		9.36	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	RSC8	YFR037C	1674 nt		9.36	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	RAS2	YNL098C	969 nt		9.35	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	RIB7	YBR153W	735 nt		9.35	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	CCT5	YJR064W	1689 nt		9.35	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	YPS3	YLR121C	1527 nt		9.35	□□□□□ -0.91
KTR6	P54070	CWC15	YDR163W	528 nt		9.33	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	TPS1	YBR126C	1488 nt		9.33	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	OYE2	YHR179W	1203 nt		9.32	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	SPP2	YOR148C	558 nt		9.32	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	INA1	YLR413W	2028 nt		9.31	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	HEM13	YDR044W	987 nt		9.3	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	EAF3	YPR023C	1206 nt		9.3	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	RPC82	YPR190C	1965 nt		9.29	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	OSH7	YHR001W	1314 nt		9.29	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	ACH1	YBL015W	1581 nt		9.29	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	SNZ1	YMR096W	894 nt		9.28	□□□□□ -0.92
KTR6	P54070	GID7	YCL039W	2238 nt		9.26	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	THI72	YOR192C	1800 nt		9.24	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	SOL2	YCR073W-A	948 nt		9.23	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	TAT2	YOL020W	1779 nt		9.22	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	ESS1	YJR017C	513 nt		9.22	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	TMA23	YMR269W	636 nt		9.22	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	YPR126C	YPR126C	309 nt		9.22	□□□□□ -0.93
KTR6	P54070	DAK2	YFL053W	1776 nt		9.21	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	VPS62	YGR141W	1404 nt		9.21	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	DDI1	YER143W	1287 nt		9.2	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	tS(GCU)L	tS(GCU)L	80 nt		9.2	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	YIL100C-A	YIL100C-A	339 nt		9.2	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	LSM5	YER146W	282 nt		9.19	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	TAF13	YML098W	504 nt		9.19	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	YDR455C	YDR455C	309 nt		9.17	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	YOR325W	YOR325W	474 nt		9.16	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	PGC1	YPL206C	966 nt		9.16	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	SPT20	YOL148C	1815 nt		9.16	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	CTI6	YPL181W	1521 nt		9.15	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	YDL086W	YDL086W	822 nt		9.15	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	PAU5	YFL020C	369 nt		9.15	□□□□□ -0.94
KTR6	P54070	IMO32	YGR031W	1029 nt		9.14	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	MHF1	YOL086W-A	273 nt		9.14	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ILV3	YJR016C	1758 nt		9.14	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	CMP2	YML057W	1815 nt		9.13	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	YMR262W	YMR262W	942 nt		9.13	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	IML3	YBR107C	738 nt		9.13	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	CCT2	YIL142W	1584 nt		9.12	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ASP3-1	YLR155C	1089 nt		9.12	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ASP3-2	YLR157C	1089 nt		9.12	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ASP3-3	YLR158C	1089 nt		9.12	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ASP3-4	YLR160C	1089 nt		9.12	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	YNL024C	YNL024C	741 nt		9.12	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ESBP6	YNL125C	2022 nt		9.1	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	POT1	YIL160C	1254 nt		9.1	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	OPI10	YOL032W	741 nt		9.1	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	STP3	YLR375W	1032 nt		9.09	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	YBR232C	YBR232C	360 nt		9.09	□□□□□ -0.95
KTR6	P54070	ERG13	YML126C	1476 nt		9.08	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	YFR036W-A	YFR036W-A	651 nt		9.08	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	RRT8	YOL048C	1029 nt		9.08	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	AIM1	YAL046C	357 nt		9.06	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	LSB6	YJL100W	1824 nt		9.05	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	HSL7	YBR133C	2484 nt		9.05	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	SPS100	YHR139C	981 nt		9.05	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	ADE8	YDR408C	645 nt		9.04	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	APS2	YJR058C	444 nt		9.04	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	SEN2	YLR105C	1134 nt		9.04	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	GSF2	YML048W	1212 nt		9.04	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	TUB4	YLR212C	1422 nt		9.03	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	MUP1	YGR055W	1725 nt		9.02	□□□□□ -0.96
KTR6	P54070	NIF3	YGL221C	867 nt		9.02	□□□□□ -0.97

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