Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PGGT1BP53609 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PGGT1BP53609 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PGGT1BP53609 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGGT1BP53609 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGGT1BP53609 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGGT1BP53609 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PGGT1BP53609 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGGT1BP53609 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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