Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms