Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDT6P53370 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUDT6P53370 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUDT6P53370 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT6P53370 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDT6P53370 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT6P53370 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT6P53370 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.8 ms