Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBX2P52951 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBX2P52951 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBX2P52951 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBX2P52951 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBX2P52951 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBX2P52951 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBX2P52951 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBX2P52951 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBX2P52951 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBX2P52951 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBX2P52951 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBX2P52951 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBX2P52951 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBX2P52951 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBX2P52951 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBX2P52951 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBX2P52951 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBX2P52951 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBX2P52951 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBX2P52951 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBX2P52951 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBX2P52951 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBX2P52951 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBX2P52951 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBX2P52951 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBX2P52951 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBX2P52951 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBX2P52951 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX2P52951 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX2P52951 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX2P52951 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX2P52951 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBX2P52951 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBX2P52951 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBX2P52951 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBX2P52951 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBX2P52951 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBX2P52951 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBX2P52951 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX2P52951 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX2P52951 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX2P52951 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX2P52951 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBX2P52951 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX2P52951 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBX2P52951 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX2P52951 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX2P52951 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX2P52951 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBX2P52951 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBX2P52951 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX2P52951 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX2P52951 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX2P52951 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBX2P52951 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBX2P52951 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBX2P52951 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBX2P52951 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBX2P52951 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX2P52951 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX2P52951 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBX2P52951 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX2P52951 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBX2P52951 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBX2P52951 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX2P52951 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX2P52951 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBX2P52951 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBX2P52951 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX2P52951 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX2P52951 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX2P52951 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBX2P52951 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBX2P52951 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX2P52951 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX2P52951 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBX2P52951 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX2P52951 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX2P52951 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX2P52951 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX2P52951 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBX2P52951 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX2P52951 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBX2P52951 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX2P52951 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX2P52951 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX2P52951 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBX2P52951 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX2P52951 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX2P52951 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX2P52951 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX2P52951 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBX2P52951 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms