Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB2P52799 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EFNB2P52799 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNB2P52799 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB2P52799 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB2P52799 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms