Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNA3P51805 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA3P51805 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA3P51805 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA3P51805 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA3P51805 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA3P51805 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms