Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB27AP51159 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RAB27AP51159 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB27AP51159 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB27AP51159 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB27AP51159 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB27AP51159 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms