Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
VEGFBP49765 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
VEGFBP49765 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
VEGFBP49765 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
VEGFBP49765 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
VEGFBP49765 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
VEGFBP49765 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
VEGFBP49765 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
VEGFBP49765 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms