Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRP9P49458 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP9P49458 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRP9P49458 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP9P49458 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP9P49458 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRP9P49458 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP9P49458 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP9P49458 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP9P49458 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP9P49458 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRP9P49458 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP9P49458 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRP9P49458 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP9P49458 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP9P49458 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRP9P49458 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRP9P49458 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP9P49458 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP9P49458 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP9P49458 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRP9P49458 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP9P49458 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRP9P49458 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP9P49458 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP9P49458 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP9P49458 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP9P49458 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP9P49458 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP9P49458 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP9P49458 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP9P49458 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP9P49458 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP9P49458 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP9P49458 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP9P49458 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP9P49458 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP9P49458 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP9P49458 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP9P49458 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP9P49458 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP9P49458 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP9P49458 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP9P49458 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP9P49458 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP9P49458 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP9P49458 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP9P49458 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRP9P49458 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRP9P49458 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRP9P49458 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRP9P49458 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRP9P49458 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRP9P49458 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRP9P49458 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRP9P49458 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRP9P49458 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRP9P49458 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRP9P49458 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRP9P49458 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRP9P49458 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRP9P49458 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRP9P49458 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRP9P49458 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRP9P49458 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRP9P49458 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRP9P49458 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRP9P49458 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRP9P49458 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRP9P49458 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRP9P49458 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRP9P49458 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRP9P49458 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP9P49458 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP9P49458 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP9P49458 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP9P49458 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRP9P49458 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP9P49458 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP9P49458 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRP9P49458 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP9P49458 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP9P49458 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP9P49458 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP9P49458 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP9P49458 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRP9P49458 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP9P49458 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP9P49458 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRP9P49458 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRP9P49458 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRP9P49458 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP9P49458 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRP9P49458 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRP9P49458 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRP9P49458 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRP9P49458 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRP9P49458 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRP9P49458 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRP9P49458 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms