Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
PtpreP49446 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
PtpreP49446 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
PtpreP49446 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
PtpreP49446 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
PtpreP49446 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
PtpreP49446 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28■■■□□ 2,07
PtpreP49446 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
PtpreP49446 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
PtpreP49446 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
PtpreP49446 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
PtpreP49446 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
PtpreP49446 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
PtpreP49446 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,89■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
PtpreP49446 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
PtpreP49446 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
PtpreP49446 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27,75■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27,73■■■□□ 2,03
PtpreP49446 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
PtpreP49446 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
PtpreP49446 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PtpreP49446 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
PtpreP49446 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
PtpreP49446 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
PtpreP49446 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
PtpreP49446 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
PtpreP49446 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
PtpreP49446 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,57■■■□□ 2
PtpreP49446 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
PtpreP49446 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27,56■■■□□ 2
PtpreP49446 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
PtpreP49446 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
PtpreP49446 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,9 ms