Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
PtpreP49446 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PtpreP49446 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PtpreP49446 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PtpreP49446 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PtpreP49446 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PtpreP49446 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PtpreP49446 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PtpreP49446 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PtpreP49446 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PtpreP49446 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PtpreP49446 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PtpreP49446 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PtpreP49446 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtpreP49446 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PtpreP49446 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtpreP49446 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtpreP49446 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PtpreP49446 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PtpreP49446 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PtpreP49446 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtpreP49446 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtpreP49446 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtpreP49446 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtpreP49446 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PtpreP49446 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtpreP49446 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtpreP49446 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PtpreP49446 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtpreP49446 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PtpreP49446 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtpreP49446 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PtpreP49446 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtpreP49446 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtpreP49446 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtpreP49446 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PtpreP49446 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtpreP49446 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtpreP49446 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtpreP49446 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PtpreP49446 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtpreP49446 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtpreP49446 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtpreP49446 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PtpreP49446 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PtpreP49446 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtpreP49446 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PtpreP49446 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtpreP49446 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtpreP49446 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtpreP49446 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtpreP49446 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PtpreP49446 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtpreP49446 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PtpreP49446 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtpreP49446 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtpreP49446 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtpreP49446 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtpreP49446 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtpreP49446 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtpreP49446 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtpreP49446 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtpreP49446 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtpreP49446 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtpreP49446 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PtpreP49446 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PtpreP49446 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtpreP49446 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtpreP49446 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtpreP49446 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtpreP49446 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtpreP49446 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtpreP49446 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtpreP49446 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtpreP49446 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpreP49446 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtpreP49446 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtpreP49446 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtpreP49446 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtpreP49446 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtpreP49446 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtpreP49446 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtpreP49446 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtpreP49446 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtpreP49446 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtpreP49446 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PtpreP49446 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtpreP49446 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtpreP49446 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtpreP49446 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtpreP49446 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtpreP49446 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtpreP49446 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtpreP49446 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtpreP49446 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PtpreP49446 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtpreP49446 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PtpreP49446 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PtpreP49446 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PtpreP49446 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
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