Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGM4P49221 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGM4P49221 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM4P49221 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM4P49221 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM4P49221 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM4P49221 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM4P49221 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM4P49221 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM4P49221 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM4P49221 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM4P49221 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM4P49221 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM4P49221 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM4P49221 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM4P49221 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGM4P49221 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TGM4P49221 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGM4P49221 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM4P49221 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM4P49221 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM4P49221 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM4P49221 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM4P49221 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM4P49221 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM4P49221 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM4P49221 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM4P49221 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM4P49221 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM4P49221 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM4P49221 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM4P49221 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM4P49221 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TGM4P49221 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TGM4P49221 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TGM4P49221 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM4P49221 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM4P49221 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM4P49221 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM4P49221 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM4P49221 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM4P49221 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM4P49221 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGM4P49221 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGM4P49221 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGM4P49221 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGM4P49221 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM4P49221 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM4P49221 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM4P49221 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM4P49221 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM4P49221 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM4P49221 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM4P49221 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM4P49221 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM4P49221 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM4P49221 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM4P49221 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM4P49221 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM4P49221 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM4P49221 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM4P49221 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM4P49221 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM4P49221 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM4P49221 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM4P49221 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM4P49221 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM4P49221 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM4P49221 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM4P49221 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM4P49221 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM4P49221 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGM4P49221 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGM4P49221 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGM4P49221 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGM4P49221 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGM4P49221 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGM4P49221 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGM4P49221 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM4P49221 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM4P49221 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM4P49221 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM4P49221 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM4P49221 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM4P49221 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM4P49221 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM4P49221 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM4P49221 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM4P49221 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM4P49221 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM4P49221 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM4P49221 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM4P49221 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM4P49221 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms