Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCKSL1P49006 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MARCKSL1P49006 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MARCKSL1P49006 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCKSL1P49006 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSL1P49006 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARCKSL1P49006 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCKSL1P49006 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCKSL1P49006 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCKSL1P49006 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARCKSL1P49006 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MARCKSL1P49006 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCKSL1P49006 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCKSL1P49006 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms