Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPR4P46093 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR4P46093 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPR4P46093 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR4P46093 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR4P46093 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR4P46093 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPR4P46093 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPR4P46093 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR4P46093 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR4P46093 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR4P46093 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR4P46093 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPR4P46093 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPR4P46093 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR4P46093 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR4P46093 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPR4P46093 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR4P46093 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPR4P46093 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR4P46093 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPR4P46093 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPR4P46093 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPR4P46093 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPR4P46093 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPR4P46093 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR4P46093 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR4P46093 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPR4P46093 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPR4P46093 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPR4P46093 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR4P46093 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR4P46093 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPR4P46093 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPR4P46093 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPR4P46093 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR4P46093 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR4P46093 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR4P46093 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPR4P46093 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR4P46093 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR4P46093 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR4P46093 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR4P46093 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPR4P46093 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR4P46093 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR4P46093 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPR4P46093 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPR4P46093 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPR4P46093 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPR4P46093 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPR4P46093 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR4P46093 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPR4P46093 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR4P46093 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR4P46093 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPR4P46093 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPR4P46093 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPR4P46093 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPR4P46093 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPR4P46093 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR4P46093 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR4P46093 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPR4P46093 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR4P46093 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR4P46093 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR4P46093 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR4P46093 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR4P46093 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR4P46093 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR4P46093 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR4P46093 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR4P46093 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR4P46093 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR4P46093 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPR4P46093 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPR4P46093 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR4P46093 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR4P46093 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR4P46093 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR4P46093 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR4P46093 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR4P46093 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR4P46093 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR4P46093 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR4P46093 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR4P46093 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms