RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P39968
VAC8, Vacuolar protein 8, yeast
Predictions only
Length
578 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAC8
P39968
LSB3
YFR024C-A
1380 nt
9.56
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
YJL118W
YJL118W
660 nt
9.55
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
STE4
YOR212W
1272 nt
9.55
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
YNR029C
YNR029C
1290 nt
9.53
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
YTH1
YPR107C
627 nt
9.53
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
YBL086C
YBL086C
1401 nt
9.53
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
UGA4
YDL210W
1716 nt
9.53
□□□□□ -0.88
VAC8
P39968
BIO5
YNR056C
1686 nt
9.52
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
PRY1
YJL079C
900 nt
9.52
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
BRR1
YPR057W
1026 nt
9.52
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
GNP1
YDR508C
1992 nt
9.52
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
TOA2
YKL058W
369 nt
9.51
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
YPL251W
YPL251W
303 nt
9.51
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
MEP3
YPR138C
1470 nt
9.51
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
LEU9
YOR108W
1815 nt
9.5
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
ALG12
YNR030W
1656 nt
9.5
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
CBK1
YNL161W
2271 nt
9.48
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
MCH5
YOR306C
1566 nt
9.47
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
AI5_BETA
Q0075
1065 nt
9.47
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
PUS5
YLR165C
765 nt
9.47
□□□□□ -0.89
VAC8
P39968
YEL008W
YEL008W
381 nt
9.46
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
VRG4
YGL225W
1014 nt
9.46
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
FHN1
YGR131W
525 nt
9.46
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
YLR349W
YLR349W
507 nt
9.46
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
YMR103C
YMR103C
363 nt
9.46
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
HXT12
YIL170W
1374 nt
9.45
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
RIB2
YOL066C
1776 nt
9.45
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
SHY1
YGR112W
1170 nt
9.44
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
ZRT3
YKL175W
1512 nt
9.44
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
DTR1
YBR180W
1719 nt
9.44
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
MLS1
YNL117W
1665 nt
9.43
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
ADH7
YCR105W
1086 nt
9.43
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
RAD51
YER095W
1203 nt
9.43
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
TRT2
tT(CGU)K
72 nt
9.43
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
KDX1
YKL161C
1302 nt
9.42
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
LSB5
YCL034W
1065 nt
9.42
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
GND2
YGR256W
1479 nt
9.41
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
SAM2
YDR502C
1155 nt
9.41
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
NUC1
YJL208C
990 nt
9.41
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
YLR122C
YLR122C
378 nt
9.41
□□□□□ -0.9
VAC8
P39968
URA6
YKL024C
615 nt
9.39
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
PAU15
YIR041W
375 nt
9.38
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
TOM20
YGR082W
552 nt
9.37
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
YJL055W
YJL055W
738 nt
9.37
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
RMA1
YKL132C
1293 nt
9.37
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
UFO1
YML088W
2007 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
CSM1
YCR086W
573 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
CPD1
YGR247W
720 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
GPN2
YOR262W
1044 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
OYE3
YPL171C
1203 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
SEC61
YLR378C
1443 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
RFC1
YOR217W
2586 nt
9.36
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
PHO23
YNL097C
993 nt
9.35
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
ATG22
YCL038C
1587 nt
9.34
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
PET8
YNL003C
855 nt
9.34
□□□□□ -0.91
VAC8
P39968
IDP3
YNL009W
1263 nt
9.33
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
BNI5
YNL166C
1347 nt
9.32
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
RPT5
YOR117W
1305 nt
9.32
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
OXA1
YER154W
1209 nt
9.32
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
RIB7
YBR153W
735 nt
9.32
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
ARA2
YMR041C
1008 nt
9.31
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
CYT2
YKL087C
675 nt
9.3
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
MSC1
YML128C
1542 nt
9.3
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
PBP1
YGR178C
2169 nt
9.29
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
AAC3
YBR085W
924 nt
9.29
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
NAR1
YNL240C
1476 nt
9.28
□□□□□ -0.92
VAC8
P39968
YER188W
YER188W
720 nt
9.27
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
MGM101
YJR144W
810 nt
9.26
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
REG2
YBR050C
1017 nt
9.26
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
CCT5
YJR064W
1689 nt
9.26
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
ILV2
YMR108W
2064 nt
9.25
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
YJL067W
YJL067W
351 nt
9.25
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
RAS2
YNL098C
969 nt
9.25
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
tS(GCU)L
tS(GCU)L
80 nt
9.24
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
ATG17
YLR423C
1254 nt
9.24
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
GAL3
YDR009W
1563 nt
9.24
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
REC114
YMR133W
1287 nt
9.22
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
SAM3
YPL274W
1764 nt
9.22
□□□□□ -0.93
VAC8
P39968
FUB1
YCR076C
753 nt
9.21
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
BNS1
YGR230W
414 nt
9.21
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
OYE2
YHR179W
1203 nt
9.21
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
YHR131C
YHR131C
2553 nt
9.21
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
CWC15
YDR163W
528 nt
9.2
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
ESS1
YJR017C
513 nt
9.2
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
TAF13
YML098W
504 nt
9.2
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
THI72
YOR192C
1800 nt
9.19
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
HDA1
YNL021W
2121 nt
9.19
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
DLD2
YDL178W
1593 nt
9.19
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
RSC8
YFR037C
1674 nt
9.19
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
TPS1
YBR126C
1488 nt
9.17
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
OSH7
YHR001W
1314 nt
9.17
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
FLR1
YBR008C
1647 nt
9.16
□□□□□ -0.94
VAC8
P39968
YPS3
YLR121C
1527 nt
9.15
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
SPP2
YOR148C
558 nt
9.14
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
EAF3
YPR023C
1206 nt
9.14
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
FMS1
YMR020W
1527 nt
9.14
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
YNL067W-A
YNL067W-A
147 nt
9.13
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
INA1
YLR413W
2028 nt
9.12
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
PAU5
YFL020C
369 nt
9.1
□□□□□ -0.95
VAC8
P39968
VPS62
YGR141W
1404 nt
9.1
□□□□□ -0.95
First
Previous
5
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10 ms