Protein–RNA interactions for Protein: P35557

GCK, Glucokinase, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCKP35557 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCKP35557 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCKP35557 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCKP35557 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCKP35557 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCKP35557 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCKP35557 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCKP35557 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCKP35557 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCKP35557 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCKP35557 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCKP35557 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCKP35557 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCKP35557 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCKP35557 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCKP35557 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCKP35557 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCKP35557 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCKP35557 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCKP35557 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCKP35557 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCKP35557 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCKP35557 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCKP35557 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCKP35557 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCKP35557 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCKP35557 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCKP35557 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCKP35557 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCKP35557 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCKP35557 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCKP35557 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCKP35557 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCKP35557 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCKP35557 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCKP35557 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCKP35557 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCKP35557 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GCKP35557 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCKP35557 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCKP35557 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCKP35557 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCKP35557 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCKP35557 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCKP35557 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCKP35557 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCKP35557 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCKP35557 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCKP35557 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCKP35557 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GCKP35557 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCKP35557 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCKP35557 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCKP35557 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCKP35557 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCKP35557 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCKP35557 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCKP35557 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCKP35557 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCKP35557 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCKP35557 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCKP35557 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCKP35557 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCKP35557 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCKP35557 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCKP35557 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCKP35557 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCKP35557 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCKP35557 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCKP35557 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCKP35557 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCKP35557 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCKP35557 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCKP35557 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCKP35557 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCKP35557 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCKP35557 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCKP35557 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCKP35557 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCKP35557 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCKP35557 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCKP35557 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCKP35557 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCKP35557 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCKP35557 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCKP35557 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCKP35557 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCKP35557 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCKP35557 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCKP35557 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCKP35557 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCKP35557 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCKP35557 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCKP35557 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCKP35557 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCKP35557 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCKP35557 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCKP35557 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCKP35557 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCKP35557 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms