Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM2P31350 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRM2P31350 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM2P31350 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM2P31350 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM2P31350 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM2P31350 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM2P31350 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM2P31350 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM2P31350 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM2P31350 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM2P31350 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM2P31350 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM2P31350 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM2P31350 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM2P31350 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM2P31350 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM2P31350 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM2P31350 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM2P31350 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRM2P31350 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRM2P31350 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM2P31350 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM2P31350 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM2P31350 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM2P31350 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM2P31350 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM2P31350 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM2P31350 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM2P31350 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM2P31350 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRM2P31350 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRM2P31350 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRM2P31350 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRM2P31350 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM2P31350 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM2P31350 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRM2P31350 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM2P31350 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRM2P31350 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRM2P31350 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRM2P31350 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM2P31350 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRM2P31350 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM2P31350 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRM2P31350 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM2P31350 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM2P31350 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRM2P31350 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM2P31350 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM2P31350 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM2P31350 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM2P31350 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRM2P31350 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM2P31350 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM2P31350 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRM2P31350 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM2P31350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM2P31350 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRM2P31350 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM2P31350 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM2P31350 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM2P31350 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRM2P31350 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM2P31350 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM2P31350 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM2P31350 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRM2P31350 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRM2P31350 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2P31350 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2P31350 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRM2P31350 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRM2P31350 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRM2P31350 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRM2P31350 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRM2P31350 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2P31350 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2P31350 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRM2P31350 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM2P31350 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM2P31350 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRM2P31350 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM2P31350 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM2P31350 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM2P31350 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRM2P31350 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM2P31350 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRM2P31350 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM2P31350 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRM2P31350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRM2P31350 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM2P31350 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRM2P31350 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRM2P31350 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms