Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC8P31273 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC8P31273 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC8P31273 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXC8P31273 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HOXC8P31273 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC8P31273 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXC8P31273 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC8P31273 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms