Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA6P31267 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA6P31267 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA6P31267 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA6P31267 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA6P31267 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA6P31267 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA6P31267 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA6P31267 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA6P31267 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms