Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXP28300 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXP28300 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXP28300 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXP28300 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXP28300 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXP28300 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXP28300 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXP28300 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXP28300 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXP28300 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXP28300 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LOXP28300 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LOXP28300 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LOXP28300 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LOXP28300 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LOXP28300 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LOXP28300 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LOXP28300 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LOXP28300 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LOXP28300 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LOXP28300 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LOXP28300 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LOXP28300 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LOXP28300 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LOXP28300 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LOXP28300 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LOXP28300 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LOXP28300 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXP28300 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LOXP28300 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXP28300 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXP28300 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXP28300 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LOXP28300 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LOXP28300 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXP28300 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXP28300 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LOXP28300 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LOXP28300 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LOXP28300 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LOXP28300 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LOXP28300 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LOXP28300 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LOXP28300 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LOXP28300 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LOXP28300 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LOXP28300 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LOXP28300 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXP28300 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXP28300 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXP28300 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXP28300 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXP28300 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXP28300 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LOXP28300 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXP28300 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXP28300 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXP28300 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXP28300 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXP28300 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXP28300 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXP28300 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXP28300 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXP28300 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXP28300 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXP28300 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXP28300 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXP28300 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXP28300 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXP28300 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXP28300 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXP28300 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXP28300 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXP28300 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXP28300 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXP28300 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXP28300 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXP28300 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXP28300 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXP28300 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXP28300 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXP28300 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOXP28300 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOXP28300 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOXP28300 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LOXP28300 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOXP28300 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LOXP28300 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOXP28300 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOXP28300 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOXP28300 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOXP28300 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LOXP28300 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms