Protein–RNA interactions for Protein: P22897

MRC1, Macrophage mannose receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRC1P22897 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MRC1P22897 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MRC1P22897 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
MRC1P22897 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MRC1P22897 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MRC1P22897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MRC1P22897 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MRC1P22897 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
MRC1P22897 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MRC1P22897 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MRC1P22897 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MRC1P22897 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MRC1P22897 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MRC1P22897 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MRC1P22897 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MRC1P22897 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
MRC1P22897 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MRC1P22897 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MRC1P22897 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
MRC1P22897 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MRC1P22897 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MRC1P22897 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MRC1P22897 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MRC1P22897 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MRC1P22897 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MRC1P22897 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MRC1P22897 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
MRC1P22897 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MRC1P22897 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MRC1P22897 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MRC1P22897 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MRC1P22897 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MRC1P22897 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MRC1P22897 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MRC1P22897 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MRC1P22897 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MRC1P22897 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MRC1P22897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MRC1P22897 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MRC1P22897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MRC1P22897 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MRC1P22897 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MRC1P22897 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MRC1P22897 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MRC1P22897 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MRC1P22897 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MRC1P22897 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MRC1P22897 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MRC1P22897 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MRC1P22897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MRC1P22897 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MRC1P22897 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MRC1P22897 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MRC1P22897 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
MRC1P22897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MRC1P22897 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
MRC1P22897 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
MRC1P22897 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MRC1P22897 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MRC1P22897 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
MRC1P22897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MRC1P22897 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MRC1P22897 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MRC1P22897 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MRC1P22897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MRC1P22897 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MRC1P22897 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MRC1P22897 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MRC1P22897 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MRC1P22897 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MRC1P22897 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
MRC1P22897 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
MRC1P22897 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MRC1P22897 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MRC1P22897 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
MRC1P22897 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MRC1P22897 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MRC1P22897 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MRC1P22897 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MRC1P22897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MRC1P22897 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MRC1P22897 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MRC1P22897 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MRC1P22897 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MRC1P22897 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MRC1P22897 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
MRC1P22897 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MRC1P22897 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MRC1P22897 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
MRC1P22897 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
MRC1P22897 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MRC1P22897 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MRC1P22897 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MRC1P22897 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms