Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BGNP21810 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BGNP21810 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BGNP21810 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BGNP21810 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BGNP21810 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BGNP21810 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BGNP21810 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BGNP21810 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BGNP21810 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BGNP21810 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BGNP21810 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BGNP21810 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BGNP21810 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BGNP21810 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BGNP21810 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BGNP21810 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BGNP21810 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BGNP21810 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BGNP21810 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BGNP21810 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BGNP21810 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BGNP21810 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BGNP21810 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BGNP21810 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BGNP21810 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BGNP21810 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BGNP21810 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BGNP21810 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BGNP21810 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BGNP21810 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BGNP21810 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BGNP21810 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BGNP21810 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BGNP21810 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BGNP21810 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BGNP21810 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BGNP21810 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BGNP21810 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BGNP21810 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BGNP21810 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BGNP21810 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BGNP21810 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BGNP21810 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BGNP21810 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BGNP21810 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BGNP21810 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BGNP21810 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BGNP21810 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BGNP21810 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BGNP21810 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BGNP21810 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BGNP21810 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BGNP21810 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BGNP21810 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BGNP21810 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BGNP21810 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BGNP21810 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BGNP21810 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BGNP21810 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BGNP21810 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BGNP21810 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BGNP21810 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BGNP21810 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BGNP21810 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BGNP21810 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BGNP21810 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BGNP21810 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BGNP21810 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BGNP21810 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BGNP21810 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BGNP21810 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BGNP21810 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BGNP21810 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BGNP21810 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BGNP21810 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BGNP21810 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BGNP21810 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BGNP21810 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BGNP21810 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BGNP21810 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BGNP21810 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BGNP21810 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BGNP21810 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BGNP21810 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BGNP21810 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BGNP21810 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BGNP21810 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BGNP21810 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BGNP21810 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BGNP21810 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BGNP21810 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BGNP21810 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BGNP21810 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BGNP21810 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BGNP21810 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BGNP21810 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BGNP21810 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BGNP21810 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BGNP21810 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms