Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PVALBP20472 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PVALBP20472 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PVALBP20472 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PVALBP20472 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PVALBP20472 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PVALBP20472 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PVALBP20472 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PVALBP20472 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PVALBP20472 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PVALBP20472 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PVALBP20472 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PVALBP20472 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PVALBP20472 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PVALBP20472 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PVALBP20472 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PVALBP20472 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PVALBP20472 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PVALBP20472 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PVALBP20472 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PVALBP20472 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PVALBP20472 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PVALBP20472 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PVALBP20472 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PVALBP20472 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PVALBP20472 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PVALBP20472 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PVALBP20472 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PVALBP20472 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PVALBP20472 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PVALBP20472 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PVALBP20472 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PVALBP20472 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PVALBP20472 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PVALBP20472 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PVALBP20472 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PVALBP20472 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PVALBP20472 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PVALBP20472 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PVALBP20472 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PVALBP20472 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PVALBP20472 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PVALBP20472 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PVALBP20472 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PVALBP20472 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PVALBP20472 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PVALBP20472 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PVALBP20472 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PVALBP20472 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PVALBP20472 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PVALBP20472 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PVALBP20472 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PVALBP20472 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PVALBP20472 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PVALBP20472 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PVALBP20472 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PVALBP20472 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PVALBP20472 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PVALBP20472 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PVALBP20472 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PVALBP20472 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PVALBP20472 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PVALBP20472 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PVALBP20472 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PVALBP20472 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PVALBP20472 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PVALBP20472 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PVALBP20472 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PVALBP20472 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PVALBP20472 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PVALBP20472 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PVALBP20472 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PVALBP20472 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PVALBP20472 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PVALBP20472 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PVALBP20472 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PVALBP20472 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PVALBP20472 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PVALBP20472 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PVALBP20472 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PVALBP20472 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PVALBP20472 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PVALBP20472 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PVALBP20472 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PVALBP20472 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PVALBP20472 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PVALBP20472 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PVALBP20472 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PVALBP20472 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PVALBP20472 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PVALBP20472 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PVALBP20472 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PVALBP20472 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PVALBP20472 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PVALBP20472 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PVALBP20472 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PVALBP20472 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PVALBP20472 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PVALBP20472 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PVALBP20472 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms