Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE6GP18545 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE6GP18545 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDE6GP18545 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDE6GP18545 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms