Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD44P16070 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CD44P16070 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD44P16070 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD44P16070 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CD44P16070 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD44P16070 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD44P16070 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD44P16070 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CD44P16070 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CD44P16070 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD44P16070 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD44P16070 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD44P16070 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD44P16070 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CD44P16070 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD44P16070 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD44P16070 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD44P16070 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD44P16070 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CD44P16070 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CD44P16070 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD44P16070 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD44P16070 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CD44P16070 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CD44P16070 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CD44P16070 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD44P16070 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD44P16070 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD44P16070 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD44P16070 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD44P16070 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD44P16070 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD44P16070 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD44P16070 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD44P16070 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD44P16070 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD44P16070 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD44P16070 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD44P16070 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD44P16070 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD44P16070 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD44P16070 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD44P16070 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD44P16070 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD44P16070 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD44P16070 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD44P16070 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD44P16070 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD44P16070 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD44P16070 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD44P16070 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD44P16070 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD44P16070 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD44P16070 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD44P16070 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD44P16070 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD44P16070 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CD44P16070 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD44P16070 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD44P16070 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD44P16070 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD44P16070 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD44P16070 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD44P16070 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CD44P16070 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CD44P16070 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CD44P16070 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CD44P16070 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CD44P16070 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD44P16070 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD44P16070 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD44P16070 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD44P16070 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD44P16070 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD44P16070 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD44P16070 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD44P16070 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD44P16070 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD44P16070 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CD44P16070 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD44P16070 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD44P16070 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD44P16070 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD44P16070 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD44P16070 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD44P16070 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD44P16070 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD44P16070 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CD44P16070 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD44P16070 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD44P16070 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD44P16070 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD44P16070 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD44P16070 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD44P16070 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD44P16070 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD44P16070 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD44P16070 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD44P16070 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms