Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CPA3P15088 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPA3P15088 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPA3P15088 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CPA3P15088 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CPA3P15088 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPA3P15088 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPA3P15088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA3P15088 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA3P15088 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA3P15088 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA3P15088 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA3P15088 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA3P15088 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA3P15088 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA3P15088 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA3P15088 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA3P15088 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA3P15088 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA3P15088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA3P15088 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA3P15088 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA3P15088 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA3P15088 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPA3P15088 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPA3P15088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA3P15088 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA3P15088 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPA3P15088 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA3P15088 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPA3P15088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA3P15088 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPA3P15088 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA3P15088 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA3P15088 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPA3P15088 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA3P15088 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA3P15088 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA3P15088 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPA3P15088 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA3P15088 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPA3P15088 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA3P15088 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA3P15088 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPA3P15088 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA3P15088 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA3P15088 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA3P15088 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA3P15088 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA3P15088 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA3P15088 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA3P15088 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA3P15088 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA3P15088 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA3P15088 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA3P15088 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA3P15088 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA3P15088 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA3P15088 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA3P15088 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA3P15088 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA3P15088 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA3P15088 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA3P15088 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA3P15088 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA3P15088 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA3P15088 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA3P15088 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA3P15088 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA3P15088 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA3P15088 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA3P15088 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CPA3P15088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA3P15088 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA3P15088 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA3P15088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA3P15088 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA3P15088 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA3P15088 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA3P15088 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA3P15088 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CPA3P15088 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA3P15088 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA3P15088 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA3P15088 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA3P15088 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA3P15088 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA3P15088 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPA3P15088 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPA3P15088 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPA3P15088 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPA3P15088 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPA3P15088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPA3P15088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms