Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CPA1P15085 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CPA1P15085 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CPA1P15085 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPA1P15085 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPA1P15085 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPA1P15085 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPA1P15085 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CPA1P15085 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CPA1P15085 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CPA1P15085 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPA1P15085 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPA1P15085 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CPA1P15085 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CPA1P15085 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CPA1P15085 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CPA1P15085 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPA1P15085 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CPA1P15085 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CPA1P15085 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CPA1P15085 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CPA1P15085 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPA1P15085 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPA1P15085 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPA1P15085 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CPA1P15085 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CPA1P15085 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CPA1P15085 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CPA1P15085 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CPA1P15085 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPA1P15085 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPA1P15085 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPA1P15085 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPA1P15085 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CPA1P15085 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPA1P15085 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPA1P15085 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPA1P15085 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPA1P15085 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPA1P15085 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CPA1P15085 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CPA1P15085 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPA1P15085 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPA1P15085 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPA1P15085 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPA1P15085 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CPA1P15085 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CPA1P15085 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CPA1P15085 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CPA1P15085 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CPA1P15085 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPA1P15085 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPA1P15085 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPA1P15085 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPA1P15085 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPA1P15085 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPA1P15085 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPA1P15085 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPA1P15085 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPA1P15085 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPA1P15085 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPA1P15085 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPA1P15085 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPA1P15085 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CPA1P15085 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CPA1P15085 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CPA1P15085 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPA1P15085 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPA1P15085 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPA1P15085 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPA1P15085 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPA1P15085 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPA1P15085 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPA1P15085 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPA1P15085 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPA1P15085 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPA1P15085 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPA1P15085 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPA1P15085 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPA1P15085 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPA1P15085 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPA1P15085 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPA1P15085 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CPA1P15085 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPA1P15085 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CPA1P15085 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CPA1P15085 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CPA1P15085 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms