Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-EP13747 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-EP13747 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HLA-EP13747 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-EP13747 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-EP13747 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-EP13747 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-EP13747 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HLA-EP13747 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms