Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETSIPP0DME0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETSIPP0DME0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SETSIPP0DME0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETSIPP0DME0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETSIPP0DME0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETSIPP0DME0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETSIPP0DME0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETSIPP0DME0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SETSIPP0DME0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms