Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RETP07949 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETP07949 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETP07949 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RETP07949 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETP07949 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETP07949 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RETP07949 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETP07949 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RETP07949 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETP07949 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RETP07949 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RETP07949 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RETP07949 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RETP07949 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RETP07949 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RETP07949 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RETP07949 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RETP07949 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RETP07949 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RETP07949 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RETP07949 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RETP07949 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RETP07949 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RETP07949 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RETP07949 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETP07949 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RETP07949 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RETP07949 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RETP07949 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RETP07949 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RETP07949 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RETP07949 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RETP07949 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETP07949 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETP07949 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETP07949 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RETP07949 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RETP07949 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RETP07949 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETP07949 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETP07949 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETP07949 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETP07949 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETP07949 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RETP07949 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RETP07949 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETP07949 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETP07949 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETP07949 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETP07949 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RETP07949 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RETP07949 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETP07949 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETP07949 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETP07949 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETP07949 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETP07949 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETP07949 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETP07949 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETP07949 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETP07949 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RETP07949 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RETP07949 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RETP07949 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RETP07949 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETP07949 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETP07949 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETP07949 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETP07949 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETP07949 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RETP07949 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RETP07949 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETP07949 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETP07949 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETP07949 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETP07949 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETP07949 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETP07949 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RETP07949 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RETP07949 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETP07949 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETP07949 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETP07949 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETP07949 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETP07949 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETP07949 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETP07949 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RETP07949 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RETP07949 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RETP07949 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RETP07949 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETP07949 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms