Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEFLP07196 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEFLP07196 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEFLP07196 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEFLP07196 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
NEFLP07196 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEFLP07196 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEFLP07196 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEFLP07196 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEFLP07196 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEFLP07196 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEFLP07196 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEFLP07196 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEFLP07196 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEFLP07196 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEFLP07196 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEFLP07196 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEFLP07196 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEFLP07196 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEFLP07196 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFLP07196 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFLP07196 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFLP07196 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFLP07196 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEFLP07196 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEFLP07196 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEFLP07196 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEFLP07196 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEFLP07196 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEFLP07196 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NEFLP07196 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEFLP07196 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NEFLP07196 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEFLP07196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEFLP07196 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEFLP07196 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEFLP07196 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEFLP07196 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEFLP07196 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEFLP07196 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEFLP07196 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEFLP07196 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NEFLP07196 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEFLP07196 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEFLP07196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEFLP07196 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEFLP07196 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEFLP07196 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEFLP07196 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEFLP07196 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEFLP07196 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEFLP07196 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEFLP07196 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEFLP07196 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEFLP07196 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEFLP07196 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEFLP07196 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEFLP07196 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFLP07196 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFLP07196 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEFLP07196 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEFLP07196 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEFLP07196 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEFLP07196 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEFLP07196 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NEFLP07196 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEFLP07196 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEFLP07196 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEFLP07196 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEFLP07196 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NEFLP07196 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NEFLP07196 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEFLP07196 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEFLP07196 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFLP07196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEFLP07196 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEFLP07196 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEFLP07196 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFLP07196 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFLP07196 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFLP07196 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEFLP07196 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEFLP07196 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEFLP07196 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEFLP07196 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEFLP07196 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEFLP07196 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEFLP07196 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFLP07196 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFLP07196 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFLP07196 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFLP07196 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEFLP07196 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEFLP07196 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEFLP07196 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEFLP07196 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEFLP07196 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEFLP07196 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEFLP07196 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEFLP07196 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms