Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTMAP06454 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTMAP06454 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTMAP06454 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTMAP06454 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMAP06454 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMAP06454 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMAP06454 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTMAP06454 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PTMAP06454 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTMAP06454 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTMAP06454 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTMAP06454 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTMAP06454 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTMAP06454 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMAP06454 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTMAP06454 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTMAP06454 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTMAP06454 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTMAP06454 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTMAP06454 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTMAP06454 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTMAP06454 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTMAP06454 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTMAP06454 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTMAP06454 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTMAP06454 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTMAP06454 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTMAP06454 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTMAP06454 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTMAP06454 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTMAP06454 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTMAP06454 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTMAP06454 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMAP06454 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMAP06454 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMAP06454 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMAP06454 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTMAP06454 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTMAP06454 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTMAP06454 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTMAP06454 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTMAP06454 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTMAP06454 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTMAP06454 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTMAP06454 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTMAP06454 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTMAP06454 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTMAP06454 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTMAP06454 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTMAP06454 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTMAP06454 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTMAP06454 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTMAP06454 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTMAP06454 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTMAP06454 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTMAP06454 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTMAP06454 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTMAP06454 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTMAP06454 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTMAP06454 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTMAP06454 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTMAP06454 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTMAP06454 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTMAP06454 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTMAP06454 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTMAP06454 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTMAP06454 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTMAP06454 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTMAP06454 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTMAP06454 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTMAP06454 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTMAP06454 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTMAP06454 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTMAP06454 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTMAP06454 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTMAP06454 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTMAP06454 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTMAP06454 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTMAP06454 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTMAP06454 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTMAP06454 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTMAP06454 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTMAP06454 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTMAP06454 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTMAP06454 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTMAP06454 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTMAP06454 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTMAP06454 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTMAP06454 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTMAP06454 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTMAP06454 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTMAP06454 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTMAP06454 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTMAP06454 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTMAP06454 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTMAP06454 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTMAP06454 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTMAP06454 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTMAP06454 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms