Protein–RNA interactions for Protein: P04637

TP53, Cellular tumor antigen p53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53P04637 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53P04637 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53P04637 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53P04637 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TP53P04637 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53P04637 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53P04637 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53P04637 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53P04637 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TP53P04637 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TP53P04637 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53P04637 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53P04637 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TP53P04637 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53P04637 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53P04637 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53P04637 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TP53P04637 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53P04637 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53P04637 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53P04637 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53P04637 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53P04637 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TP53P04637 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TP53P04637 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TP53P04637 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TP53P04637 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53P04637 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TP53P04637 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53P04637 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP53P04637 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53P04637 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53P04637 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP53P04637 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP53P04637 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53P04637 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53P04637 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP53P04637 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53P04637 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TP53P04637 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53P04637 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53P04637 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53P04637 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53P04637 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53P04637 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53P04637 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53P04637 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53P04637 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53P04637 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53P04637 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP53P04637 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP53P04637 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP53P04637 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53P04637 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53P04637 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53P04637 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP53P04637 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53P04637 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53P04637 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53P04637 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53P04637 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53P04637 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53P04637 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53P04637 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53P04637 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53P04637 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53P04637 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53P04637 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53P04637 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53P04637 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53P04637 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53P04637 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53P04637 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53P04637 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53P04637 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53P04637 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53P04637 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53P04637 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53P04637 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53P04637 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53P04637 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP53P04637 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53P04637 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53P04637 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53P04637 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53P04637 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53P04637 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53P04637 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53P04637 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53P04637 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53P04637 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53P04637 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53P04637 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53P04637 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53P04637 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53P04637 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53P04637 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53P04637 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53P04637 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53P04637 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms