Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MT-ND1P03886 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MT-ND1P03886 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MT-ND1P03886 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-ND1P03886 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MT-ND1P03886 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-ND1P03886 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms