Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTA1P02549 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTA1P02549 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTA1P02549 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTA1P02549 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTA1P02549 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTA1P02549 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTA1P02549 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTA1P02549 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTA1P02549 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms