Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
IGHV3-7P01780 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGHV3-7P01780 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV3-7P01780 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IGHV3-7P01780 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHV3-7P01780 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms