Protein–RNA interactions for Protein: P00738

HP, Haptoglobin, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPP00738 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPP00738 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPP00738 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPP00738 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPP00738 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPP00738 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPP00738 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPP00738 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HPP00738 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPP00738 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPP00738 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPP00738 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPP00738 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPP00738 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPP00738 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPP00738 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPP00738 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPP00738 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPP00738 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPP00738 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPP00738 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPP00738 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPP00738 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPP00738 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPP00738 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPP00738 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPP00738 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPP00738 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPP00738 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HPP00738 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPP00738 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPP00738 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPP00738 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPP00738 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPP00738 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPP00738 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPP00738 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HPP00738 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPP00738 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPP00738 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HPP00738 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPP00738 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPP00738 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPP00738 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPP00738 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPP00738 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPP00738 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPP00738 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPP00738 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPP00738 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPP00738 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPP00738 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPP00738 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPP00738 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPP00738 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HPP00738 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPP00738 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPP00738 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPP00738 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPP00738 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HPP00738 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPP00738 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPP00738 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPP00738 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPP00738 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPP00738 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPP00738 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPP00738 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPP00738 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPP00738 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPP00738 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPP00738 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPP00738 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPP00738 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPP00738 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPP00738 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPP00738 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPP00738 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPP00738 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPP00738 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPP00738 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPP00738 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPP00738 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPP00738 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPP00738 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPP00738 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPP00738 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPP00738 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPP00738 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPP00738 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPP00738 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HPP00738 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPP00738 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPP00738 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HPP00738 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPP00738 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPP00738 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPP00738 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPP00738 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPP00738 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms