Protein–RNA interactions for Protein: O95992

CH25H, Cholesterol 25-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CH25HO95992 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CH25HO95992 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CH25HO95992 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CH25HO95992 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CH25HO95992 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CH25HO95992 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CH25HO95992 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CH25HO95992 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CH25HO95992 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CH25HO95992 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CH25HO95992 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CH25HO95992 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CH25HO95992 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CH25HO95992 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CH25HO95992 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CH25HO95992 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CH25HO95992 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CH25HO95992 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CH25HO95992 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CH25HO95992 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CH25HO95992 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CH25HO95992 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CH25HO95992 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CH25HO95992 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CH25HO95992 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CH25HO95992 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CH25HO95992 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CH25HO95992 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CH25HO95992 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CH25HO95992 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CH25HO95992 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CH25HO95992 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CH25HO95992 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CH25HO95992 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CH25HO95992 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CH25HO95992 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CH25HO95992 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CH25HO95992 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CH25HO95992 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CH25HO95992 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CH25HO95992 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CH25HO95992 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CH25HO95992 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CH25HO95992 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CH25HO95992 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CH25HO95992 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CH25HO95992 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CH25HO95992 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CH25HO95992 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CH25HO95992 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CH25HO95992 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CH25HO95992 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CH25HO95992 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CH25HO95992 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CH25HO95992 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CH25HO95992 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CH25HO95992 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CH25HO95992 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CH25HO95992 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CH25HO95992 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CH25HO95992 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CH25HO95992 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CH25HO95992 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CH25HO95992 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CH25HO95992 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CH25HO95992 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CH25HO95992 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CH25HO95992 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CH25HO95992 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CH25HO95992 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CH25HO95992 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CH25HO95992 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CH25HO95992 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CH25HO95992 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CH25HO95992 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CH25HO95992 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CH25HO95992 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CH25HO95992 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CH25HO95992 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CH25HO95992 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CH25HO95992 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CH25HO95992 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CH25HO95992 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CH25HO95992 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CH25HO95992 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CH25HO95992 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CH25HO95992 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CH25HO95992 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CH25HO95992 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CH25HO95992 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CH25HO95992 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CH25HO95992 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CH25HO95992 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CH25HO95992 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CH25HO95992 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CH25HO95992 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CH25HO95992 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CH25HO95992 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CH25HO95992 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CH25HO95992 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms