Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACSL3O95573 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACSL3O95573 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACSL3O95573 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACSL3O95573 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACSL3O95573 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACSL3O95573 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACSL3O95573 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACSL3O95573 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms