Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SVILO95425 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SVILO95425 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SVILO95425 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SVILO95425 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SVILO95425 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SVILO95425 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SVILO95425 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVILO95425 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVILO95425 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVILO95425 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVILO95425 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SVILO95425 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SVILO95425 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVILO95425 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVILO95425 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVILO95425 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVILO95425 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVILO95425 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVILO95425 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVILO95425 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVILO95425 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVILO95425 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVILO95425 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVILO95425 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVILO95425 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVILO95425 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVILO95425 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVILO95425 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVILO95425 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVILO95425 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SVILO95425 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SVILO95425 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVILO95425 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVILO95425 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SVILO95425 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVILO95425 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SVILO95425 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SVILO95425 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SVILO95425 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVILO95425 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVILO95425 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVILO95425 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVILO95425 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVILO95425 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVILO95425 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVILO95425 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVILO95425 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVILO95425 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVILO95425 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVILO95425 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVILO95425 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVILO95425 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVILO95425 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVILO95425 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVILO95425 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVILO95425 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SVILO95425 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SVILO95425 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVILO95425 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVILO95425 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVILO95425 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVILO95425 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVILO95425 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SVILO95425 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SVILO95425 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SVILO95425 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SVILO95425 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SVILO95425 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVILO95425 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVILO95425 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVILO95425 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVILO95425 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SVILO95425 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SVILO95425 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SVILO95425 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SVILO95425 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SVILO95425 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SVILO95425 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SVILO95425 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SVILO95425 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SVILO95425 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SVILO95425 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SVILO95425 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SVILO95425 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SVILO95425 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SVILO95425 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVILO95425 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVILO95425 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVILO95425 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVILO95425 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SVILO95425 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SVILO95425 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SVILO95425 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms