Protein–RNA interactions for Protein: O76050

NEURL1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1O76050 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1O76050 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEURL1O76050 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1O76050 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEURL1O76050 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEURL1O76050 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEURL1O76050 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEURL1O76050 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1O76050 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1O76050 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1O76050 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1O76050 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1O76050 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1O76050 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms